En cliquant sur une ou plusieurs images dans Aperture, les utilisateurs peuvent faire leur choix au sein d'un menu de modules installés et appliquer des opérations d'imagerie spécialisées à des images TIFF ou RAW. Apple travaille en étroite collaboration avec des développeurs majeurs pour offrir à Aperture les modules les plus demandés, notamment :

• le module Viveza de Nik Software, reposant sur la technologie U Point, qui offre un moyen simple, puissant et précis de contrôler de manière sélective et d'ajuster la couleur et la luminosité des images numériques ;
• le module Noise Ninja de PictureCode, qui apporte un outil évolué d'analyse et de réduction du bruit ISO élevé ;
• le module Power Stroke de Digital Film Tools, qui propose une interface simple à base de coups de pinceau permettant de masquer rapidement des zones et d'y effectuer des ajustements ciblés ;
• le module Dfx de The Tiffen Company, qui offre une suite en pleine expansion de filtres et d'effets créatifs ;
• le module dpMatte de dvGarage, qui se compose d'un outil d'incrustation hautes performances permettant la création de composites parfaits, et le module HDRtoner, permettant de sélectionner plusieurs photos pour créer une unique image HDR (High Dynamic Range) ;
• enfin, les modules d'Image Trends, dont Fisheye-Hemi, qui permet de corriger rapidement et facilement la distorsion des objectifs fisheye, ShineOff, qui élimine automatiquement les reflets sur la peau, et PearlyWhites, qui renforce automatiquement la blancheur et l'éclat des dents.